Scooby-Doo Mystery Inc.
La banda e' alle prese con la scuola e con i propri genitori in un paesino di nome Crystal Cove. Velma attira i visitatori nel museo del paese dove sono esposte le statue dei mostri che hanno smascherato e intanto cerca di approfondire i rapporti con Shaggy. I genitori di Shaggy e il padre di Fred, il sindaco, non vogliono far loro risolvere altri misteri perche' pensano sia pericoloso. Quelli di Daphne non approvano il suo amore per Fred e i misteri. I ragazzi vengono contattati da un misterioso individuo chiamato Mr. E che mandera' diversi messaggi ed indovinelli attraverso i quali dovranno risolvere i vari misteri di Crystal Cove. Un altro problema e' il professor Pericles, un personaggio sconosciuto che poi si rivelera' un genio-pappagallo (fuggito dal manicomio per animali) che conosce il segreto dell'originale Mystery Incorporated (Inc.), una giovane squadra di investigatori che ad un certo punto scomparve in maniera misteriosa. Lui e Mr. E sembra siano nemici ed i ragazzi si troveranno nel mezzo. Il segreto sembra essere racchiuso in una specie di disco fatto a pezzi i quali riuniti assieme ad una mappa dovrebbero condurre ad un enorme tesoro all'origine di tutto.